Az egykori koronázóváros legfontosabb helyszíne, melyet a mai fehérváriak is óvnak. Nem így a törökök, akik még megvárták, míg a szultán távozik a városból, majd kifosztották a királysírokat. 1568-ban a szultán rendelettel utasította a budai béget, hogy távolíttassa el a bazilika sírköveit, mert azok sértik a muzulmán hitet. Ekkor törték össze többek között Nagy Lajos és mások sírköveit is.

1601-ben egy évre sikerült visszafoglalni a várost a törököktől, ám ez roppant nagy áldozattal járt. A Koronázó Bazilika legmagasabb tornya, a Pipó torony – amit a törökök lőporraktárnak használtak – ugyanis felrobbant és romba döntötte a koronázótemplom Bazilika nagy részét. A török elnyomásnak 1688-ban vége szakadt, ekkor szabadult fel a város a török uralom alól véglegesen. A törökök szabad elvonulást kértek és kaptak a magyaroktól. A fogyó hold végleg eltűnt Fehérvár egéről.